Trong đó, có nội dung liên quan đến việc Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam (VEC) chỉ định Công ty Yên Khánh thu phí cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình là đúng hay sai? Nếu sai thì sai thế nào so với quy định của pháp luật?.
Liên quan đến vấn đề lựa chọn Công ty Yên Khánh làm dịch vụ thu phí cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình, Bộ Giao thông vận tải (GTVT) vừa ra văn bản số 11678/BGTVT-TTr do thứ trưởng Lê Đình Thọ ký, gửi Bộ Kế hoạch và Đầu tư (KH&ĐT) về việc xin ý kiến liên quan đến đấu thầu thu phí, trạm dừng nghỉ các dự án đường cao tốc do Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam quản lý và khai thác.
Quá trình lựa chọn Công ty Yên Khánh làm dịch vụ thu phí dự án cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình
Theo văn bản số 11678/BGTVT – TTr của Thứ trưởng Lê Đình Thọ ký ngày 15/10 vừa qua, tuyến cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình được hoàn thành đưa vào khai thác tạm ngày 30/6/2012. VEC được Bộ GTVT giao quản lý khai thác và thu phí theo các Quyết định số 2451/ QĐ – BGTVT ngày 28/10/2011 và các Quyết định số 1532/QĐ – BGTVT, số 1533/QĐ – BGTVT ngày 29/6/2012.
Ngày 04/7/2012, Công ty Yên Khánh có văn bản số 84/2012/CV – ĐB gửi Bộ GTVT về việc đề xuất tổ chức dịch vụ quản lý thu phí đường cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình, văn bản có bút phê của Bộ trưởng GTVT Đinh La Thăng, kính chuyển thứ trưởng Nguyễn Hồng Trường (ngày 05/7/2012), Thứ trưởng Trường kính chuyển Vụ Tài chính để xử lý.

Văn bản của Bộ GTVT gửi Bộ KH-ĐT
Ngày 12/7/2012, Bộ GTVT có văn bản số 5429/BGTVT – TC gửi VEC, trong đó có ghi: “Căn cứ các quy định hiện hành, nhằm giảm chi phí gián tiếp, Tổng công ty trực tiếp đàm phán với Nhà đầu tư để xử lý theo đúng thẩm quyền”.
Theo đó, ngày 31/7/2012 Tổng giám đốc VEC có văn bản số 2010/TTr – VEC gửi Hội đồng thành viên (HĐTV) xin chủ trương nhượng quyền thu phí dự án xây dựng đường cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình; HĐTV có nghị quyết số 316/NQ – VEC – HĐTV ngày 07/8/2012 thống nhất chủ trương để Tổng giám đốc VEC chỉ đạo phòng tham mưu tính toán cụ thể trình Tổng giám đốc phương án giải quyết.
Ngày 24/7/2012, Công ty Yên Khánh có văn bản số 92/CV gửi VEC đề xuất xin chủ trương mua lại quyền thu phí đường bộ Dự án cao tốc Pháp Vân – Cầu Giẽ - Ninh Bình.
Ngày 11/9/2012, VEC có văn bản số 2389/VEC – KHĐT yêu cầu Công ty Yên Khánh lập phương án chính thức về phương án tổ chức thu phí Cầu Giẽ - Ninh Bình.

Câu "hỏi khó"của Bộ GTVT gửi Bộ KH-ĐT
Công ty Yên Khánh có văn bản số 106/ CV – YK ngày 17/9/2012 về phương án tổ chức thu phí Cầu Giẽ - Ninh Bình. Căn cứ văn bản của Công ty Yên Khánh ngày 19/10/2012, VEC có văn bản số 2792/VEC – BC báo cáo Bộ GTVT xin chủ trương ký hợp đồng dịch vụ thu phí Dự án xây dựng đường cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình.
Ngay sau khi có văn bản đề xuất của VEC, Bộ GTVT chỉ đạo VEC và Công ty Yên Khánh tiến hành đàm phán việc thực hiện dịch vụ thu phí cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình. Ngày 07/12/2012 VEC đã tiến hành đàm phán với Công ty Yên Khánh và HĐTV đã ban hành nghị quyết số 486/NQ – VEC – HĐTV ngày 18/12/2012 thống nhất chủ trương giao Công ty Yên Khánh thực hiện dịch vụ thu phí cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình theo tinh thần chỉ đạo tại Nghị quyết số 316/NQ – VEC – HĐTV ngày 07/8/2012, giao Tổng giám đốc thực hiện ký hợp đồng, đồng thời báo cáo Bộ GTVT.
Đằng sau công ty Yên Khánh ?
Bà Vũ Thị Hoan, nguyên Giám đốc công ty Yên Khánh, được biết đến là nữ đại gia trẻ trong lĩnh vực hạ tầng giao thông, cũng chính là nhân vật đặc biệt thâu tóm quyền thu phí cao tốc dự án cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình từ tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam (VEC). Bà Hoan cũng vừa bị bắt tạm giam thời hạn 4 tháng theo Quyết định khởi tố vụ án số 04/QĐ-KTV về tội 'vi phạm các quy định về quản lý đất đai' theo Điều 229 Bộ luật Hình sự năm 2015 và Quyết định khởi tố bị can số 12/QĐ-KTBC, Lệnh bắt bị can để tạm giam số 07/LBBC-ĐTG, Lệnh tạm giam số 07/L-TG.
Tại thời điểm bị bắt, bà Vũ Thị Hoan ngoài chức giám đốc Công ty cổ phần Yên Khánh Hải Thành còn là giám đốc Công ty cổ phần Tập đoàn Yên Khánh, tiền thân là Công ty TNHH sản xuất thương mại dịch vụ Yên Khánh.
Mặc dù, VEC đã chấm dứt hợp đồng với công ty Yên Khánh vào ngày 22/11/2017, tuy nhiên những điểm khuất tất khi công ty Yên Khánh được “bật đèn xanh” thu phí trên cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình đến nay vẫn chưa được làm rõ. Liệu có việc bao che cho những sai phạm tại VEC?